В третьем сезоне напряжение достигает предела. Кая и её друзья оказываются втянуты в открытый конфликт с могущественной корпорацией «Гринс», которая пытается контролировать океан и его ресурсы. Подводные базы корпорации теперь выглядят не как научные станции, а как военные крепости. Кая сталкивается с новым командиром «Гринс» — хладнокровным мужчиной, который не гнушается использовать запрещённые технологии, чтобы сломать волю протестующих. Он устраивает диверсию, подрывая старую исследовательскую платформу, и подставляет активистов. Кае приходится не только бороться с внешней угрозой, но и разбираться с предательством внутри своей команды. Один из старых союзников начинает действовать за её спиной, и это ставит под удар всю операцию по спасению уникального подводного города, который «Гринс» хочет уничтожить ради добычи редких минералов.

Параллельно с этим Кая пытается понять природу странного сигнала, который она уловила на глубине. Этот сигнал мешает работе их оборудования и вызывает галлюцинации у членов экипажа. Девушка решает спуститься в опасную зону, где обитают неизвестные формы жизни, способные искажать реальность. Она берёт с собой только старого друга-биолога, но их субмарина попадает в ловушку — гигантский кальмар повреждает двигатель. Вокруг сгущается тьма, а кислород на исходе. Кая понимает, что сигнал — не просто помеха, а попытка контакта. Но времени на раздумья нет: «Гринс» активирует своё секретное оружие, и океан начинает буквально закипать вокруг героев. Каждый шаг теперь может стать последним, а доверять нельзя никому.